Para la mayoría de los dueños de una LLC, no te pagas un salario. Mueves dinero de la cuenta de la LLC a la tuya, y pagas impuestos sobre la ganancia de la LLC, no sobre la cantidad que moviste. Qué regla aplica depende de cómo clasifica el IRS a la LLC.
Una LLC de un solo miembro es una entidad ignorada (disregarded entity), salvo que haya elegido otra cosa. Su ganancia va en tu propio Formulario 1040, normalmente en el Schedule C, y el IRS dice que el dueño debe el impuesto sobre el trabajo por cuenta propia (self-employment tax) sobre ella de la misma manera que un propietario único. Sacar el dinero, lo que suele llamarse un retiro del dueño (owner's draw), no es un hecho imponible aparte ni un gasto del negocio.
Una LLC con dos o más miembros es una sociedad (partnership) por defecto. El IRS es directo en esto: los socios no son empleados y no se les debe emitir un Formulario W-2. Se les paga mediante distribuciones o pagos garantizados, que se informan en el Schedule K-1 que sale del Formulario 1065 de la LLC.
Solo si la LLC eligió tributar como corporación, un dueño que trabaja en ella pasa a ser su empleado, y se le pagan salarios por nómina. El IRS espera que ese pago sea razonable para los servicios prestados, y puede ajustar ambas declaraciones si a un directivo (officer) se le paga de menos.
En los dos primeros casos no se retiene nada de lo que sacas, así que el impuesto se paga con pagos estimados. El IRS divide el año en cuatro períodos de pago y puede cobrar una multa si pagas de menos en cualquiera de ellos, aunque al final te corresponda un reembolso. El impuesto sobre el trabajo por cuenta propia es del 15.3%, 12.4% para el Seguro Social y 2.9% para Medicare, una vez que las ganancias netas llegan a $400.
Si vives fuera de Estados Unidos y eres el único dueño de la LLC, sigue siendo una entidad ignorada, pero el IRS la trata como una corporación para un propósito: informar las transacciones contigo. El dinero que aportas y el dinero que sacas se deben informar en el Formulario 5472, presentado junto con un Formulario 1120 pro forma, por cada año en que ocurran.